Nisko położone jest na typowym obszarze nizinnym zaliczanym przez geografów do Kotliny Sandomierskiej. Na północ od miasta znajduje się koryto rzeki San, a na południu pozostałości Puszczy Sandomierskiej. Miasto jest podzielone na dzielnice: Barce, Malce, Moskale, Warchoły, Podwolina, Centrum. Od zachodu graniczy ze Stalową Wolą, natomiast od wschodu z wsiami Wolina oraz Racławice.